Subordinação
O 5º CGCFEx é uma Unidade Setorial de Gestão, Contabilidade e Controle Interno diretamente subordinada à Secretaria de Economia e Finanças (SEF) possuindo um canal técnico com o Centro de Controle Interno do Exército (CCIEx).
Legenda:
| SEF | Secretaria de Economia e Finanças |
| CCIEx | Centro de Controle Interno do Exército |
| CPEx | Centro de Pagamento do Exército |
| D Cont | Diretoria de Contabilidade |
| DGO | Diretoria de Gestão Orçamentária |
| IEFEx | Instituto de Economia e Finanças do Exército |
| AOFin | Assessoria Especial de Orçamento e Finanças |
| APG | Assessoria de Planejamento e Gestão |
| CGCFEx | Centro Gestão, Contabilidade e Finanças do Exército |